کتابخانه ملاصدرا در دانشکده علوم دانشگاه شیراز واقع شده است که بنام فیلسوف الهی قرن یازدهم، مرحوم صدرالمتالهین (ملاصدرا ) نامگذاری گردیده است و قبل از آن نیز به کتابخانه علم و هنر معروف بوده است. این کتابخانه در اوایل دهه 1430 به عنوان کتابخانه مرکزی دانشگاه شیراز تأسیس و تحت عنوان کتابخانه دانشگاهی فعالیت خود را آغاز نمود. در سال 1363 کتابخانه ملاصدرا به دو قسمت تفکیک شد و مجموعه مربوط به ادبیات و علوم انسانی به کتابخانه میرزای شیرازی منتقل گردید و منابع مربوط به رشته های علوم پایه (فیزیک، شیمی، ریاضی، زمین شناسی، زیست شناسی و آمار) در کتابخانه باقی ماند. بعد از تفکیک کتابخانه به مرور حجم کتابها و نشریات افزایش یافت. این کتابخانه دارای کامل ترین سری نشریات Abstracts Chemical در خاورمیانه می باشد که از سال 1934 تاکنون تهیه گردیده و همچنین شامل

مجموعه Abstracts در رشته های فیزیک، زمین شناسی و زیست شناسی نیز می باشد. کتابخانه ملاصدرا به خاطر منابع بسیار غنی شامل کتب، پایان نامهها و نشریات، یکی از غنیترین کتابخانه های دانشگاهی و به عنوان تنها قطب نگهداری منابع علوم پایه در جنوب کشور می باشد.

کتابخانه ملاصدرا اولین کتابخانه دانشگاه شیراز است که به سیستم کامپیوتری مجهز شد. با توجه به افزایش حجم منابع کتابخانه، نیاز به ساخت بنای جدیدی جهت گسترش آن احساس می شد. بنابراین از سال 1375 کار ساخت و ساز ساختمان جدید کتابخانه ملاصدرا آغاز و در سال 1385 به بهره برداری رسید. این ساختمان در مجاورت ساختمان قدیم کتابخانه بنا شده و دارای ۴ طبقه و ۸ سالن میباشد. مخزن کتاب، پایان نامه و مرجع در دو طبقه واقع شده، بخش اداری و سه سالن مطالعه نیز در دو طبقه دیگر واقع شده است. بخش نشریات و ۳ سالن مطالعه نیز در ساختمان قدیمی کتابخانه قرار دارد. زیر بنای بخش قدیمی و جدید 3599 مترمربع می باشد. مجموعه کتابهای فارسی، لاتین، پایان نامه و مرجع کتابخانه ملاصدرا به  ساختمان کتابخانه مرکزی و مرکز اسناد دانشگاه منتقل شده است.